中医学院（新安学院）

• 中医基础理论[100501]
• 中医临床基础[100502]
• 中医医史文献[100503]
• 方剂学[100504]
• 中医诊断学[100505]

针灸推拿学院 （康复医学院）

• 针灸推拿学[100512]

中西医结合学院（生命科学学院）

• 中西医结合基础[100601]
• 微生物与生化药学[100705]
• 药理学[100706]

药学院

• 药物化学[100701]
• 药剂学[100702]
• 生药学[100703]
• 药物分析学[100704]
• 微生物与生化药学[100705]
• 药理学[100706]
• 社会与管理药学[1007Z1]
• 中药学[100800]
• 药学[105500]
• 中药学[105600]

中国科学院上海药物研究所

• 药学[105500]
• 中药学[105600]

医药信息工程学院

• 中医工程学[1006Z1]

医药经济管理学院

• 社会医学与卫生事业管理[120402]

护理学院

• 中医护理学[1005Z1]
• 护理[105400]

人文与国际教育交流学院（国际合作中心）

• 中医文化学[1005Z2]

第一临床医学院（第一附属医院、安徽省中医院）

• 中医内科学[100506]
• 中医外科学[100507]
• 中医骨伤科学[100508]
• 中医妇科学[100509]
• 中医儿科学[100510]
• 中医五官科学[100511]
• 针灸推拿学[100512]
• 中西医结合临床[100602]
• 中医内科学 [105701]
• 中医外科学 [105702]
• 中医骨伤科学[105703]
• 中医妇科学 [105704]
• 中医儿科学 [105705]
• 中医五官科学 [105706]
• 针灸推拿学 [105707]
• 中西医结合临床[105709]
• 全科医学(中医，不授博士学位)[105710]

第二临床医学院（第二附属医院、安徽省针灸医院）

• 中医内科学[100506]
• 中医骨伤科学[100508]
• 针灸推拿学[100512]
• 中医内科学[105701]
• 中医骨伤科学[105703]
• 针灸推拿学[105707]

第三临床医学院（第三附属医院、安徽省中西医结合医院、神经病学研究所）

• 中西医结合临床[100602]
• 中西医结合临床[105709]

安徽中医药大学附属芜湖医院（芜湖市中医医院）

• 中医内科学 [105701]
• 中医外科学[105702]
• 中医骨伤科学[105703]
• 中医妇科学 [105704]
• 中医儿科学 [105705]
• 针灸推拿学 [105707]
• 中西医结合临床[105709]

安徽中医药大学附属六安市中医院

• 中医内科学 [105701]
• 中医外科学 [105702]
• 中医骨伤科学[105703]
• 中医妇科学 [105704]
• 中医五官科学 [105706]
• 针灸推拿学 [105707]
• 中西医结合临床[105709]

安医大一附院高新院区

• 中医内科学[100506]
• 中西医结合临床[100602]
• 中医内科学 [105701]
• 中西医结合临床[105709]

安徽中医药大学附属太和县中医院

• 中医内科学 [105701]
• 中医外科学 [105702]
• 中医骨伤科学[105703]
• 中医儿科学 [105705]
• 中医五官科学 [105706]
• 中西医结合临床[105709]

安徽中医药大学附属滁州中西医结合医院

• 中医内科学 [105701]
• 中医外科学 [105702]
• 中医骨伤科学[105703]
• 中西医结合临床[105709]
• 全科医学[105710]

徐州市中医院

• 中医内科学[105701]
• 中医外科学 [105702]
• 中医妇科学 [105704]
• 针灸推拿学 [105707]
• 中西医结合临床[105709]

苏州市中医医院

• 中医内科学[105701]
• 中医外科学 [105702]
• 中医骨伤科学[105703]
• 中医妇科学 [105704]

安徽中医药大学附属铜陵市中医医院

• 中医内科学[105701]
• 中医外科学 [105702]
• 中医骨伤科学[105703]
• 中医妇科学 [105704]
• 中医五官科学 [105706]
• 中西医结合临床[105709]